蒙古族原居大漠以北。铁木真击败各部落,完成了蒙古的统一,于公元1206年建蒙古国,称成吉思汗。蒙古军在灭西夏(公元1227年)、灭金(公元1234年)以前,发动西侵,至于中亚、东欧、波斯;以后又两次西侵。这个以和林(今蒙古人民共和国哈尔和林)为中心的横跨欧亚的大汗国,不久就分裂成几个独立的汗国,名义上奉蒙古皇帝为大汗。公元1271年忽必烈改国号为元,以金中都为大都。公元1276年元灭南宋,统一南北。此后十余年中,元军屡次入侵邻国,多败少胜。元朝任用汉地士人兴儒学,定制度,设中书省管理行政,枢密院司军事。中书省辖河北、山东、山西等“腹里”地区,余地分设行中书省(行省)。全国有驿站联系,沟通信息。
元朝的北方承长期战乱之后,破坏严重。元世祖提倡农垦,修治黄河。为蒙古贵族和官府需要的手工业,都设局管理,用匠户生产。民间棉织业、丝织业相当发达。 通惠河的开凿使大运河可以直达大都,便利漕运。近海航运也较发达。纸币“交钞”行用于全国。西方人旅居中国的很多,称色目人。许多色目人经营国内外贸易,拥有特权。大都在那时是一个国际都会。
蒙古政权对汉人剥削压迫严重,引起汉人的强烈反抗。元顺帝妥欢贴睦尔时以宗教和秘密结社为纽带的农民暴动遍及全国。至正十一年(公元1351年),修治黄河的民工中爆发了以红巾为标志的大起义,迅速蔓延到河淮广大地区,继续向四方扩展。红巾军徐寿辉、彭莹玉部攻下杭州,众至百万。刘福通部于至正十五年于亳州奉韩林儿为帝,稍后分兵三路北攻元军。至正二十三年刘福通败。濠州红巾军朱元璋过江在苏、皖、浙一带压平各支割据势力,罗致士人,振兴农业,不久就奄有东南半壁。至正二十七年朱元璋北伐,以“驱逐胡虏,恢复中华”为号召,第二年进据大都,建立明朝。